Protein–RNA interactions for Protein: E9PYH6

Setd1a, SET domain-containing 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1aE9PYH6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Setd1aE9PYH6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Setd1aE9PYH6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36,93■■■■□ 3,5
Setd1aE9PYH6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36,92■■■■□ 3,5
Setd1aE9PYH6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36,91■■■■□ 3,5
Setd1aE9PYH6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Setd1aE9PYH6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Setd1aE9PYH6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Setd1aE9PYH6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Setd1aE9PYH6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36,81■■■■□ 3,48
Setd1aE9PYH6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Setd1aE9PYH6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Setd1aE9PYH6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Setd1aE9PYH6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Setd1aE9PYH6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Setd1aE9PYH6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Setd1aE9PYH6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Setd1aE9PYH6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Setd1aE9PYH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,7■■■■□ 3,47
Setd1aE9PYH6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Setd1aE9PYH6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,68■■■■□ 3,46
Setd1aE9PYH6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Setd1aE9PYH6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36,67■■■■□ 3,46
Setd1aE9PYH6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Setd1aE9PYH6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,64■■■■□ 3,46
Setd1aE9PYH6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36,63■■■■□ 3,45
Setd1aE9PYH6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,61■■■■□ 3,45
Setd1aE9PYH6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,6■■■■□ 3,45
Setd1aE9PYH6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Setd1aE9PYH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36,59■■■■□ 3,45
Setd1aE9PYH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Setd1aE9PYH6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36,57■■■■□ 3,45
Setd1aE9PYH6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Setd1aE9PYH6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Setd1aE9PYH6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36,55■■■■□ 3,44
Setd1aE9PYH6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Setd1aE9PYH6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Setd1aE9PYH6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Setd1aE9PYH6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Setd1aE9PYH6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,51■■■■□ 3,44
Setd1aE9PYH6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Setd1aE9PYH6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36,47■■■■□ 3,43
Setd1aE9PYH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Setd1aE9PYH6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Setd1aE9PYH6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Setd1aE9PYH6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Setd1aE9PYH6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Setd1aE9PYH6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Setd1aE9PYH6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Setd1aE9PYH6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Setd1aE9PYH6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Setd1aE9PYH6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Setd1aE9PYH6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Setd1aE9PYH6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Setd1aE9PYH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Setd1aE9PYH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Setd1aE9PYH6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Setd1aE9PYH6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36,34■■■■□ 3,41
Setd1aE9PYH6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
Setd1aE9PYH6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36,32■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Setd1aE9PYH6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Setd1aE9PYH6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Setd1aE9PYH6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Setd1aE9PYH6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Setd1aE9PYH6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36,21■■■■□ 3,39
Setd1aE9PYH6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Setd1aE9PYH6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36,18■■■■□ 3,38
Setd1aE9PYH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Setd1aE9PYH6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,18■■■■□ 3,38
Setd1aE9PYH6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Setd1aE9PYH6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Setd1aE9PYH6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Setd1aE9PYH6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Setd1aE9PYH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Setd1aE9PYH6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Setd1aE9PYH6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Setd1aE9PYH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Setd1aE9PYH6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
Setd1aE9PYH6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Setd1aE9PYH6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Setd1aE9PYH6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35,91■■■■□ 3,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,4 ms