Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim20D3Z7Q2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim20D3Z7Q2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim20D3Z7Q2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim20D3Z7Q2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim20D3Z7Q2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms