Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1500009C09RikD3YYW9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1500009C09RikD3YYW9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1500009C09RikD3YYW9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1500009C09RikD3YYW9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1500009C09RikD3YYW9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1500009C09RikD3YYW9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1500009C09RikD3YYW9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1500009C09RikD3YYW9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1500009C09RikD3YYW9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1500009C09RikD3YYW9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1500009C09RikD3YYW9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1500009C09RikD3YYW9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1500009C09RikD3YYW9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1500009C09RikD3YYW9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1500009C09RikD3YYW9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1500009C09RikD3YYW9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1500009C09RikD3YYW9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1500009C09RikD3YYW9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms