Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Proca1B0QZF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Proca1B0QZF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Proca1B0QZF7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Proca1B0QZF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Proca1B0QZF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Proca1B0QZF7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Proca1B0QZF7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Proca1B0QZF7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Proca1B0QZF7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Proca1B0QZF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Proca1B0QZF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Proca1B0QZF7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Proca1B0QZF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Proca1B0QZF7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Proca1B0QZF7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Proca1B0QZF7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Proca1B0QZF7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Proca1B0QZF7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Proca1B0QZF7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Proca1B0QZF7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Proca1B0QZF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Proca1B0QZF7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Proca1B0QZF7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Proca1B0QZF7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Proca1B0QZF7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Proca1B0QZF7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Proca1B0QZF7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Proca1B0QZF7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Proca1B0QZF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Proca1B0QZF7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Proca1B0QZF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Proca1B0QZF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Proca1B0QZF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms