Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint4A7TZF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint4A7TZF3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint4A7TZF3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint4A7TZF3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint4A7TZF3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint4A7TZF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint4A7TZF3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint4A7TZF3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint4A7TZF3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skint4A7TZF3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint4A7TZF3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skint4A7TZF3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Skint4A7TZF3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skint4A7TZF3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint4A7TZF3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint4A7TZF3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint4A7TZF3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint4A7TZF3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint4A7TZF3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint4A7TZF3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint4A7TZF3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint4A7TZF3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint4A7TZF3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint4A7TZF3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint4A7TZF3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint4A7TZF3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint4A7TZF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint4A7TZF3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint4A7TZF3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint4A7TZF3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint4A7TZF3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint4A7TZF3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint4A7TZF3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint4A7TZF3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint4A7TZF3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint4A7TZF3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Skint4A7TZF3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint4A7TZF3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint4A7TZF3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint4A7TZF3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms