Protein–RNA interactions for Protein: A2AFI6

Gm364, Transmembrane 9 superfamily member, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm364A2AFI6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm364A2AFI6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm364A2AFI6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm364A2AFI6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm364A2AFI6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm364A2AFI6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm364A2AFI6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm364A2AFI6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm364A2AFI6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm364A2AFI6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm364A2AFI6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm364A2AFI6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm364A2AFI6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm364A2AFI6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm364A2AFI6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm364A2AFI6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm364A2AFI6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm364A2AFI6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm364A2AFI6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm364A2AFI6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm364A2AFI6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm364A2AFI6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm364A2AFI6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm364A2AFI6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm364A2AFI6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm364A2AFI6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm364A2AFI6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm364A2AFI6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm364A2AFI6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm364A2AFI6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm364A2AFI6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm364A2AFI6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm364A2AFI6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm364A2AFI6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms