Protein–RNA interactions for Protein: A1Y9I9

Tomt, Transmembrane O-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TomtA1Y9I9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TomtA1Y9I9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TomtA1Y9I9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TomtA1Y9I9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TomtA1Y9I9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TomtA1Y9I9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TomtA1Y9I9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TomtA1Y9I9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TomtA1Y9I9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TomtA1Y9I9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TomtA1Y9I9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TomtA1Y9I9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TomtA1Y9I9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TomtA1Y9I9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TomtA1Y9I9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TomtA1Y9I9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TomtA1Y9I9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TomtA1Y9I9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TomtA1Y9I9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TomtA1Y9I9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TomtA1Y9I9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TomtA1Y9I9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TomtA1Y9I9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TomtA1Y9I9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TomtA1Y9I9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TomtA1Y9I9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TomtA1Y9I9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TomtA1Y9I9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TomtA1Y9I9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TomtA1Y9I9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TomtA1Y9I9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TomtA1Y9I9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TomtA1Y9I9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TomtA1Y9I9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TomtA1Y9I9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TomtA1Y9I9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TomtA1Y9I9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TomtA1Y9I9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TomtA1Y9I9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TomtA1Y9I9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TomtA1Y9I9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TomtA1Y9I9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TomtA1Y9I9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TomtA1Y9I9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TomtA1Y9I9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TomtA1Y9I9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TomtA1Y9I9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TomtA1Y9I9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TomtA1Y9I9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TomtA1Y9I9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TomtA1Y9I9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TomtA1Y9I9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TomtA1Y9I9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms