Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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