Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RfxankQ9Z205 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RfxankQ9Z205 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RfxankQ9Z205 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RfxankQ9Z205 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RfxankQ9Z205 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RfxankQ9Z205 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RfxankQ9Z205 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms