Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clic1Q9Z1Q5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms