Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx39bQ9Z1N5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms