Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dctn3Q9Z0Y1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dctn3Q9Z0Y1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dctn3Q9Z0Y1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dctn3Q9Z0Y1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms