Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nup160Q9Z0W3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Nup160Q9Z0W3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms