Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf15Q9Z0J7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms