Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn1Q9Z0I7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn1Q9Z0I7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms