Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp46a1Q9WVK8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms