Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx9Q9WUH2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx9Q9WUH2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms