Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU67

Ly6i, Lymphocyte antigen 6I, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6iQ9WU67 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6iQ9WU67 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ly6iQ9WU67 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6iQ9WU67 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms