Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scnn1bQ9WU38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms