Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms