Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma1Q9R1P4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms