Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zeb2Q9R0G7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms