Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClnkQ9QZE2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms