Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn8Q9QZ49 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.3 ms