Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms