Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phtf1Q9QZ09 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms