Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms