Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxe3Q9QY14 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms