Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml5Q9QXS8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.5 ms