Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copg2Q9QXK3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg2Q9QXK3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms