Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms