Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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