Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS9

Reg3d, Reg III delta, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3dQ9QUS9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Reg3dQ9QUS9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Reg3dQ9QUS9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms