Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms