Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms