Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf1Q9JM58 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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