Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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