Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms