Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms