Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg3Q9JL95 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms