Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk3aQ9JKX8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms