Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms