Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms