Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms