Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin1Q9JKF6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms