Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PigbQ9JJQ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PigbQ9JJQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigbQ9JJQ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigbQ9JJQ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigbQ9JJQ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigbQ9JJQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigbQ9JJQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PigbQ9JJQ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms