Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cml1Q9JIZ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms