Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6l2Q9JIM3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6l2Q9JIM3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 506.2 ms