Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc22Q9JIG7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms