Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI43

Rhox4b, Homeobox protein EHOX, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4bQ9JI43 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms